| 演讲者 | Xihao Hu | | 头衔职位 | 寻百会公司首席科学家 | | 时间 | 2019 年 9 月 24 日上午 10:00-11:00 | | 地点 | 复旦大学邯郸校区老逸夫楼 604 | | 承办单位 | 上海市智能信息处理重点实验室 | | 联系人 | 朱山风，zhusf@fudan.edu.cn |
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演讲简介
被切除的癌症样本中除了癌细胞，还有大量的免疫细胞，其中就包括 T 细胞和 B 细胞。B 细胞可以识别不同的抗原并分泌出大量的抗体参与到抗癌反应中。我们通过重新分析公共的癌症 RNA 高通量测序数据，得到了几百万个抗体序列。通过序列比对，我们发现了广泛的 B 细胞家族，其中含有大量特定位点的变异 (Somatic hypermutations)，代表了 B 细胞结合力成熟的天然过程。同时，通过分析抗体的 Fc 区域，我们发现很多 B 细胞家族中都有不同类型的 Fc 同种型变换 (Isotype switch)。通过进一步研究基于抗体的 NK 细胞免疫逃逸机制，我们发现不同类型 B 细胞的比例对于癌症病人的预后有相关性。在以上工作发表到 Nature Genetics 之后，我们进一步采用深度学习的方法来分析抗癌抗体和抗原的关系。通过迁移学习，我们发现由 RNA 数据学习的模型可以准确地预测市场上最好的三种 anti-PD1 抗体药的亲和力。基于此模型，我们预测并合成了新的抗体序列，并将其打入到老鼠的癌症模型中。强有力的 in vitro 和 in vivo 结果显示，通过大数据挖掘和人工智能，我们寻百会公司的技术平台可以很高效地得到全人源的抗体药物。
关于讲者
胡熙浩博士于 2015 年在香港中文大学获得博士学位，后在哈佛大学 Dana-Farber 刘小乐教授实验室完成了博士后的研究，现在是寻百会公司的首席科学家。胡博士有十多年的生物信息研究史，精通机器学习和生物统计建模，发表了 20 篇期刊文章，包括 Nature Genetics, Nature Biotechnology, Nucleic Acids Research, Bioinformatics 等主流期刊。2009 年，胡熙浩代表复旦大学获得了免疫机器学习大赛 (Machine Learning in Immunology) 中 HLA-peptide 结合预测的单项第一名。2019 年，胡博士被致力于发展免疫疗法的 Parker Institute 评为 Parker Scholar，并评价为 “癌症免疫疗法领域的新星”。
